คริสตจักรได้ก่อตั้งขึ้นในช่วงปี ค.ศ.1990 โดยกลุ่มมิชชันนารีของ Campus Outreach จากประเทศสหรัฐอเมริกาที่มาทำพันธกิจนักศึกษาในประเทศไทย เพื่อรองรับผู้เชื่อจากพันธกิจนักศึกษา โดยเริ่มต้นใช้ชื่อว่า คริสตจักรพันธสัญญากรุงเทพ ต่อมาในปี 1998 ได้มีการขยายพันธกิจและสร้างคริสตจักรที่จังหวัดขอนแก่น ชื่อว่าคริสตจักรพันธสัญญาขอนแก่น หลังจากนั้นได้มีการขยายไปต่อที่จังหวัดเชียงใหม่ด้วย คริสตจักรพันธสัญญากรุงเทพได้อยู่ภายใต้การนำและดูแลของกลุ่มมิชชันนารี จนในช่วงปี ค.ศ. 2004 ได้มีการมอบหมายให้ผู้รับใช้คนไทยเข้ามาเป็นผู้นำคริสตจักรอย่างเต็มตัว คริสตจักรได้กลายเป็นคริสตจักรของคนไทยอย่างแท้จริง ซึ่งได้ออกจากการดูแลและการสนับสนุนของ Campus Outreach นับตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา คริสตจักรยังดำเนินต่อไปด้วยพันธกิจหลัก คือ พันธกิจนักศึกษาในหมาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยศรีปทุม มหาวิทยาลัยหอการค้า และราชภัฎจันทรเกษม ในตอนนั้นก็ยังมีกลุ่มมัชชันนารี United World Mission จากสหรัฐอเมริกาเข้ามาช่วยงานพันธกิจนักศึกษาอยู่บ้าง จนในปี 2015 เป็นปีที่ไม่มีมัชชันนารีเข้ามาช่วยงานพันธกิจ ทำให้เกิดสภาพแห้งเหี่ยวทางจิตวิญญาณอย่างเห็นได้ชัด เนื่องจากมีพันธกิจนักศึกษาเป็นพันธกิจหลักมาตลอด แม้ว่าในระหว่างนั้นทางคริสตจักรจะมีนิมิตและได้มีพันธกิจอื่นๆ และอาจจะเป็นผลสืบเนื่องจากการออกมาเป็นคริสตจักรที่ปกครองโดยคนไทยเต็มตัวในขณะที่คริสตจักรไม่พร้อม ดังนั้นผู้นำและสมาชิกมีความเห็นร่วมกันว่า ควรจัดให้มีปีสะบาโตของคริสตจักรเพื่อฟื้นฟูใจและชีวิตฝ่ายวิญญาณของสมาชิกในคริสตจักร โดยไปร่วมนมัสการกับคริสตจักร Grace City ตั้งแต่ต้นปี 2016 เป็นเวลา...
